El Fondo Nacional de Recursos (FNR) se creó en el año 1980, pero desde ese año hasta el 2004 sólo financiaba procedimientos: cirugías cardíacas, trasplantes de órganos, prótesis, diálisis, etcétera. Desde hace 13 años también se hace cargo de 56 medicamentos de alto costo, que sirven para 22 patologías, que están relacionadas a varios tipos de cáncer, a esclerosis múltiples, artritis, algunos para el Sida y para varias enfermedades crónicas, entre otros. Para la cobertura de medicamentos se invierten US$ 50 millones anuales. Desde la Secretaría de Comunicación Institucional, así lo explicó su directora, Alicia Ferreira: «Uno de los grandes cambios que hubo con el Sistema Nacional Integrado de Salud (SNIS) es que se creó el formulario terapéutico nacional que obliga a todas las instituciones, públicas o privadas, a brindar medicamentos que están dentro de ese formulario», explicó Ferreira. En ese formulario hay un anexo para medicamentos de alto precio, que permite que los pacientes los reciban con el financiamiento del Fondo Nacional de Recursos. Ferreira recordó que la ley de Presupuesto 2005-2009 indica que el FNR «financiará los procedimientos de alta complejidad y los medicamentos», incorporados en ese momento. Ferreira aclaró que los procedimientos se siguen financiando.
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