Saralegui integró el Tribunal de honor que se le realizó al capitán de fragata Juan Carlos Larcebeau, hoy fallecido, fue condenado en el 2021 por el asesinato y la desaparición de 38 personas en el marco del Plan Cóndor en una causa por la que también fueron sentenciados otros militares retirados. Larcebeau también fue condenado por la justicia uruguaya en el 2009 junto a Gregorio Álvarez por 29 homicidios cometidos durante la dictadura.
El tribunal de honor de la Armada Nacional consideró en 2018 que el capitán de fragata era “un ejemplo” a seguir. Aquel tribunal, cuyas conclusiones fueron avaladas por el entonces comandante de la Armada, Carlos Abilleira –aunque no fue homologado por el entonces presidente Tabaré Vázquez–, estuvo integrado por los capitanes de navío Marcelo Pazos, Gabriel Guida y Marcos Saralegui, según informó en 2020 El Observador.